記者6月11日從中國農業科學院獲悉，該院作物科學研究所水稻優異種質資本創造利用團隊聯盟北京大學當代農學院，首次組裝了平凡野生稻單倍型無空隙染色體基因組，構建了野生稻種質資本優異基因挖掘利用與種質創造平臺，并鑒定了關鍵的耐鹽與抗稻瘟病基因。相關研究成績日前發布在國際期刊《天然通信》上。
栽培稻是從二倍體平凡野生稻馴化而來，目前已成為世界上過份一半人口的主食。然而，在栽培稻的馴化和育種過程中，非生物耐受性和生物抗性等很多有益性狀丟失或者被削弱。而且，野生稻雜合度高導致基因組組裝難題，大批優異抗性基因與不利性狀連鎖，育種中更難以直接利用。所以，創建一個可用于野生稻基因挖掘的高效平臺，對于野生稻資本利用和水稻品種改善具有主要意義。
論文通信作者、中國農業科學院作物科學研究所研究員楊慶文通知記者，研究團隊以綜合抗性良好的中國平凡野生稻Y476為載體，首次組裝了單倍型無空隙染色體基因組。他們以此為根基，差別以秈稻9311和粳稻日本晴為受體親本，構建了兩套蓋住全基因組的染色體片斷置換系，建立了一個能夠高通量鑒定挖掘野生稻優異基因的平經典賽 運彩臺。
在這項工作中，我們通過整合高通量高區分率染色體構象逮捕、全基因組光學圖譜、納米孔測序和高保真測序等專業，對二倍體平凡野生稻種質進行單倍型分析的玩運彩場中投注無空隙運彩 進洞基因組組裝和注釋。與之前組裝的二倍體平凡野生稻基因組比擬，該基因組組裝在持續性、完整性和正確性方面有了顯著改良。這意味著，該平臺將加快野生稻的性能基因組學研究，并為稻種資本利用與品種遺傳改善提供進步工具。楊慶文說。
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栽培稻是從二倍體平凡野生稻馴化而來，目前已成為世界上過份一半人口的主食。然而，在栽培稻的馴化和育種過程中，非生物耐受性和生物抗性等很多有益性狀丟失或者被削弱。而且，野生稻雜合度高導致基因組組裝難題，大批優異抗性基因與不利性狀連鎖，育種中更難以直接利用。所以，創建一個可用于野生稻基因挖掘的高效平臺，對于野生稻資本利用和水稻品種改善具有主要意義。
論文通信作者、中國農業科學院作物科學研究所研究員楊慶文通知記者，研究團隊以綜合抗性良好的中國平凡野生稻Y476為載體，首次組裝了單倍型無空隙染色體基因組。他們以此為根基，差別以秈稻9311和粳稻日本晴為受體親本，構建了兩套蓋住全基因組的染色體片斷置換系，建立了一個能夠高通量鑒定挖掘野生稻優異基因的平臺。
在這項工作中，我們通過整合高通量高區分率染色體構象逮捕、全基因組光學圖譜、納米孔測序和高保真測序等專業，對二倍體平凡野生稻種質進行單倍型分析的無空隙基因組組裝和注釋。與之前組裝的二倍體平凡野生稻基因組比擬，該基因組組裝在持續性、完整性和正確性方面有了顯著改良。這意味著，該平臺將加快野生稻的性能基因組學研究，并為稻種資本利用與品種遺傳改善提供進步工具。楊慶文說。
